Cell | 建立人类树突状巨噬细胞与辅助性T巨噬细胞相互作用模型

细胞膜-细胞膜作用力异常十分复杂，涵盖大量底物与频率渠道，学界钻研多年，仍旧是管中窥豹。来自法国巴黎PSL研究成果大学的Vassili Soumelis团队于在Cell杂志上发表篇文章A Quantitative Multivariate Model of Human DendriticCell-T Helper Cell Communication的评论，创设了物理与假说融为一体的研究成果方法有，物理上，在蛋白质高标准测定了细胞膜所腺体的细胞膜因子与应激反应；假说上，创设了频率输入转换成彼此间的联系和作用力关连。写作者以人类树突圆锥形细胞膜（Dendritic cell，又称DC）与这两项T细胞膜（T Helper cell，又称Th）彼此间的作用力为研究成果某类，分析了36例DC系统性的频率底物和17种Th腺体的细胞膜因子，并依靠这些零碎数据创设数学模HG，演算出56种并未被物理证明的细胞膜相互关连，与此同时，还推测出290种有可能关连，并证明了IL-12p70可以通过IL-1频率渠道作用于17HG这两项T细胞膜（又称Th17）。首先，写作者采集了人类单核细胞膜是从的DC（MoDCs）和骨骼肌血液CD11c+DC（bDCs）两类细胞膜，并冲动24天内。所采用的冲动频率主要包含三大类共计14种。第一种：内源频率底物，以外干扰素beta（interferon β，又称IFN-β），GM-CSF， TSLP和 PGE2；第二种：Toll都为肽的配基，以外Toll4肽的激动剂脂多糖（ lipopolysaccharide，又称LPS），Toll1/2肽激动剂PAM3CSK4，Dectin1激动剂Curdlan，Toll2/Dectin1激动剂 zymosan，Toll7/8肽激动剂R848，Toll3肽激动剂 poly(I：C) 和NLRP3炎症小体活化剂铝钾；第三种：细细菌病毒，以外高温灭活的Candida albicans （又称HKCA），李斯特细菌（Listeria monocytogenes，又称HKLM），Staphylococcus aureus （又称HKSA）， Streptococcus pneumoniae （又称HKSP）和毒株（influenza virus，又称flu）。年中，写作者通过流式细胞膜术等方法有，测定了36种DC系统性底物的理解上述情况，其中，29种属于细胞膜表面，7种属于细胞膜腺体上清初之中。调查结果，除了一些已知的DC细胞膜响应正因如此，写作者还有了一些重新发现：（1）zymosan冲动的MoDCs 理解高高标准的CD54 和PVR；（2）毒株冲动的MoDCs可以作用于ICOSL；（3）LPS冲动的MoDCs 可以作用于高高标准的CD30L和CD83。再下来，写作者将这些冲动过的DC与T细胞膜上海交通大学6天，随后测定Th的抑制效率以及17种Th系统性细胞膜因子的理解腺体上述情况。有趣的是，写作者将Th和DC的表现相互相比较，发现，这二者彼此间并不存在一一对应的关连，也就是说，两种冲动物对DC产生的真实感类似，但是，这两种冲动物所执行的DC与T细胞膜上海交通大学之后，产生的真实感很可以截然相异。接着，写作者采用生物个人信息学的方法有，以上述物理零碎数据创设模HG。简单来说，写作者综合DC转换成的36种频率底物和Th转换成的17种效应底物，将两两彼此间的关连简化为“相反调节”和“负向调节”两种，并且，还加入零碎数据库和已发表典籍中的个人信息，创设了十分复杂的频率调节互联网。例如，通过这一模HG，写作者发现， IL-10的负向调节底物以外OX40L， 4-1BBL， IL-12， TNF-α， CD58， VISTA，Galectin-3， CD80， CD29， IL-1， ICAM-3， SLAMF3， IL-28a和CD83，而相反调节底物以外Jagged-2， PDL1， IL-10， CD11a， HLA-DR， ICOSL， CD100， CD30L， CD18， ICAM-2和CD86，这都为，给以DC相异的冲动频率，写作者就可以推断出Th响应细胞膜IL-10的理解腺体上述情况。最后，写作者利用这都为模HG，企图推测并证明重新细胞膜相互关连。通过创设的模HG，写作者发现，IL-12在与IL-1， ICAM-2或者Jagged-2协力腺体时，偏向于调节IL-17F，而与CD70， IL-23或者 LIGHT 协力显现出来时，则更偏向于调节IL-17A。另外，敲除IL-12，IL-17A和IL-17F的理解高标准都除此以外减缓。这些结果说明，IL-12参与Th17的作用于分化。为了全面探讨IL-12作用于Th17的机制，写作者采用体外作用于Th的模HG，发现，IL-12并无法直接作用于Th17，但是，同时加入IL-1和IL-12，Th17就作用于出来了。这是一篇物理与假说融为一体的佳作。物理结果与计算建模相互支持，相互指导，相得益彰。如下图简述，物理大多采用了紧密共同点两大多零碎数据，一是何种冲动下DC细胞膜的响应，二是响应后的DC对T细胞膜的作用。假说大多以DC和T细胞膜的转换成细胞膜因子为核心，创设了细胞膜因子彼此间的相反和负向调节互联网模HG。通过这一模HG，写作者预测出一些重新细胞膜间相互关连，之后再用物理证明这些关连是否属实。这篇评论的亮点有两处，一是创设和物理假说融为一体研究成果的除此以外，二是评论中提供的诸多细胞膜调节个人信息以供研究成果参考。零碎出处：Grandclaudon M1, Perrot-Dockès M2, Trichot C1, et al.A Quantitative Multivariate Model of Human Dendritic Cell-T Helper Cell Communication.Cell. 2019 Oct 3;179(2):432-447.e21. doi: 10.1016/j.cell.2019.09.012.